Как известно, наш клуб успешно участвовал не только в чемпионате, но и в кубке Узбекистана. Первым розыгрышем кубка для нашей команд стал 2003-й год. Тогда в региональной подгруппе «Локомотив» занял 3 место. Первым же матчем в истории клуба стоит считать матч с «Кимёгаром», в котором мы победили со счетом 2:4
В 2004 году, «железнодорожники» впервые в своей истории дошли до ¼ финала. Обыграв на своем пути «Навбахор» и «Андижан». В 2005 году, также наша команда дошла до ¼ финала. В 2010 году «Локомотив» впервые вышел в полуфинал. На пути к полуфиналу, «Локо» обыгрывал всех соперников и подошел к стадии с разницей 20-4. В 2010 году мы повторили это достижения, дойдя до полуфинала
А 2014 год стал по-настоящему историческим. «Локомотив» впервые в своей истории стал Обладателем Кубка страны, обыграв в Алмалыке «Бунедкор» со счётом 1:0. Гол забил Жасур Хасанов. Что интересно, в том финале играли два действующих игрока клуба Марат Бикмаев и Садриддин Абдуллаев. В 2016 году «Локомотив» сделал реванш за поражение в полуфинале 2015 года у каршинского «Насафа» и выиграл со счетом 1:0. Уже на второй минуте Темурходжа Абдухаликов забил победный мяч
Дальше «Локомотиву» удалось развить свой успех и в следующем розыгрыше кубка. 4 декабря 2017 года, «Локо» обыграл «Бунедкор», благодаря мячу Марата Бикмаева, завоевав третий Кубок в своей истории
История «Локомотива» в Кубке Узбекистана
2003 – групповой этап
2004 – Четвертьфинал
2005 – Четвертьфинал
2006 – 1/8 финала
2007 – 1/16 финала
2008 – 1/16 финала
2009 – 1/16 финала
2010 – Полуфинал
2011 – 1/8 финала
2012 – Четвертьфинал
2013 – Полуфинал
2014 – ПОБЕДА
2015 — Полуфинал
2016 – ПОБЕДА
2017 – ПОБЕДА
2018 – Четвертьфинал
2019 – 1/8 финала
2020 – 1/8 финала